Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Tspan1Q99J59 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms