Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ9

Prdm9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm9Q96EQ9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prdm9Q96EQ9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prdm9Q96EQ9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms