Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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