Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SptssbQ925E8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SptssbQ925E8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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