Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Csmd1Q923L3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Csmd1Q923L3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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