Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sf3b5Q923D4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b5Q923D4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms