Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med28Q920D3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms