Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chrna2Q91X60 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms