Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usb1Q91W78 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usb1Q91W78 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms