Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klc3Q91W40 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klc3Q91W40 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms