Protein–RNA interactions for Protein: Q91VS8

Farp2, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp2Q91VS8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Farp2Q91VS8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Farp2Q91VS8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms