Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms