Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vps4aQ8VEJ9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vps4aQ8VEJ9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms