Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc115Q8VE99 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc115Q8VE99 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms