Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE2

Gpn1, GPN-loop GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn1Q8VCE2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gpn1Q8VCE2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gpn1Q8VCE2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpn1Q8VCE2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpn1Q8VCE2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpn1Q8VCE2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpn1Q8VCE2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpn1Q8VCE2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpn1Q8VCE2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpn1Q8VCE2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gpn1Q8VCE2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms