Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp3Q8R4B8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp3Q8R4B8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms