Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Vmn1r200Q8R281 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Vmn1r200Q8R281 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Vmn1r200Q8R281 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r200Q8R281 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r200Q8R281 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Vmn1r200Q8R281 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r200Q8R281 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r200Q8R281 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r200Q8R281 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r200Q8R281 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r200Q8R281 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r200Q8R281 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Vmn1r200Q8R281 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r200Q8R281 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r200Q8R281 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Vmn1r200Q8R281 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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