Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg10Q8R1P4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg10Q8R1P4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms