Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxc12Q8K5B8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc12Q8K5B8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms