Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prpf39Q8K2Z2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prpf39Q8K2Z2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms