Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf13Q8K2W6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms