Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek9Q8K1R7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms