Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H7

Slc45a3, Solute carrier family 45 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a3Q8K0H7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc45a3Q8K0H7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc45a3Q8K0H7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms