Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf628Q8CJ78 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms