Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam20aQ8CID3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam20aQ8CID3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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