Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Upp2Q8CGR7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp2Q8CGR7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms