Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc28bQ8CEG5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc28bQ8CEG5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc28bQ8CEG5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc28bQ8CEG5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc28bQ8CEG5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc28bQ8CEG5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc28bQ8CEG5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc28bQ8CEG5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms