Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc63Q8CDV6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc63Q8CDV6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms