Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrrc9Q8CDN9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms