Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrn3Q8CBC6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrn3Q8CBC6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms