Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4aQ8C9S8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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