Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Usp20Q8C6M1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Usp20Q8C6M1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Usp20Q8C6M1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Usp20Q8C6M1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp20Q8C6M1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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