Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q8C5C9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q8C5C9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q8C5C9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q8C5C9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q8C5C9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q8C5C9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q8C5C9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms