Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssuh2Q8C3L1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssuh2Q8C3L1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssuh2Q8C3L1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssuh2Q8C3L1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssuh2Q8C3L1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssuh2Q8C3L1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssuh2Q8C3L1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssuh2Q8C3L1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssuh2Q8C3L1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ssuh2Q8C3L1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssuh2Q8C3L1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms