Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strip1Q8C079 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strip1Q8C079 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Strip1Q8C079 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip1Q8C079 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip1Q8C079 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip1Q8C079 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip1Q8C079 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip1Q8C079 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip1Q8C079 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip1Q8C079 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip1Q8C079 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip1Q8C079 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip1Q8C079 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip1Q8C079 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Strip1Q8C079 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Strip1Q8C079 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Strip1Q8C079 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Strip1Q8C079 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms