Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp47Q8BY87 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp47Q8BY87 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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