Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp40Q8BWR4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms