Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PcgF3Q8BTQ0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms