Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pbrm1Q8BSQ9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pbrm1Q8BSQ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pbrm1Q8BSQ9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms