Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Zcchc4Q8BKW4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zcchc4Q8BKW4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms