Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ubash3bQ8BGG7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms