Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8BGC1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8BGC1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q8BGC1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8BGC1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q8BGC1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q8BGC1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q8BGC1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q8BGC1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q8BGC1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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