Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sv2bQ8BG39 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sv2bQ8BG39 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sv2bQ8BG39 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sv2bQ8BG39 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms