Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnpo1Q8BFY9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms