Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srgap3Q812A2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms