Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfascQ810U3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfascQ810U3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms