Protein–RNA interactions for Protein: Q810Q5

Nmes1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmes1Q810Q5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmes1Q810Q5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmes1Q810Q5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmes1Q810Q5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmes1Q810Q5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmes1Q810Q5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmes1Q810Q5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmes1Q810Q5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmes1Q810Q5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmes1Q810Q5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmes1Q810Q5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmes1Q810Q5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmes1Q810Q5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nmes1Q810Q5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nmes1Q810Q5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nmes1Q810Q5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmes1Q810Q5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms