Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Liat1Q810M6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Liat1Q810M6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms