Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prima1Q810F0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prima1Q810F0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms