Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cracr2bQ80ZJ8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms